金陵是东林党的老巢，东林党人声势浩荡、咄咄逼人的态势，让优柔寡断的史可法顿时举棋不定。而对史可法来说，他虽然不是东林党人，但却是东林党元老左光斗的门生，他的立场多少都会倾向于东林党，因为他担心，万一成功登位的朱由崧秋后算账，说不准自己也会牵连进去。
正当史可法举棋不定的时候，马士英找上门来助推了他一把。
马士英是个五十多岁的武将，字瑶草，贵州贵阳人，万历四十七年（公元1619年）进士，历任金陵户部主事、郎中、大同知府等职。崇祯三年，迁任山西阳和道副使仅一个月，因以金钱交结朝中权贵，遭镇守太监弹劾，发配金陵。崇祯十五年，在好友阮大铖的帮助下得以复出，在金陵任兵部右侍郎兼右佥都御史，总督庐州、凤阳等处军务。
有军界为他撑腰，史可法底气硬了不少。他很快便与马士英沆瀣一气，将南京兵部右侍郎吕大器、南京都御史张慎言等东林党人对福王朱由崧的诋毁之辞，向马士英和盘托出。
福王在藩期间不忠不孝，恐难主天下。史可法向马士英密谋道，东林党人还定了他七宗罪，‘不孝、虐下、干预有司、不读书、贪、淫、酗酒。’。
史可法所言非虚，在李自成攻陷洛阳的时候，福王朱由菘只顾自己逃命，结果连老爹朱常洵都让人给煮了。在南逃的路上，他还是只顾自己逃命，结果亲妈走散，下落不明。这样的人品，不单单是一个不孝就能说明问题的。
于是，南明的皇帝，在史可法和马士英的操控下，新鲜出炉了，出乎所有人的意料，被认定为皇上的既非亲而不贤的福王，也非贤而不亲的潞王，而是既亲又贤的桂王朱常瀛。
可是，这样密谋定下来的皇帝是难以服众的。这个桂王本身就不占多少优势，第一，桂王是朱由检的叔叔，伦理上还是属于舍亲立疏、侄终叔及；第二，福王、潞王此时身在淮安，距离南京不过两三天路程，而桂王远在广西，快马加鞭赶来上任也得一两个月，地理位置吃了大亏。
不过，这一结果倒是令东林党人高兴了一阵子，在他们看来，当初提议潞王也是不得已，只要不选福王，让自己不会被秋后算账，谁做这个皇帝都无所谓。
满心欢喜的东林党人开始筹划派人去广西迎接桂王登基，金陵表面上一团和气、皆大欢喜，史可法也以为大局已定，等着向即将登基的朱常瀛邀功领赏。
史可法高兴得太早了，乱世之中，谁掌握了军权，谁说了才算。
那么在金陵是谁掌握了军权呢？
左良玉，字昆山，临清人。自从在罗英山被高峻山大败之后，一蹶不振，被马士英调往徐州与义军对峙，目前只有兵马万余人，已经不会有人去注意他的存在。
高杰，字英吾，陕西米脂人。与李自成同邑，同起为盗，原为李自成部将，绰号翻山鹞，于崇祯八年降明。与同为李自成部将的刘良佐兵败被俘而投降不同，高杰是主动弃暗投明的，因为他捅了娄子——勾搭上了李自成的夫人邢氏。
黄得功，号虎山，明末开原卫人，其先自合肥徙。军中号黄闯子，为京营名将，在与义军的战争中，他迫降义军五营兵，擒马武，杀王兴国，战功赫赫，升任庐州总兵。